本实用新型是一种电动起子连接轴结构，该连接轴包括有：一个上连接轴，在该上连接轴轴内部具有两截不同形状的两段式轴孔；及一个下连接轴，在该下连接轴外周具有两截不同形状的两段式轴面；借由将该上、下连接轴相对应的轴、孔设计成特殊的两段式轴孔与两段式轴面相互配合，结合时具有导引作用，连结时能达到较佳的同心作用，同时也能提供更稳固的联结作用，以减少锁附误差而获得良好螺锁品质，并进一步延长连接轴的使用寿命。