本实用新型涉及饮品加工技术领域，提供一种活性原料在线添加系统和饮品加工产线。上述活性原料在线添加系统包括：进料装置、微滤膜过滤器、深层过滤装置和除菌过滤装置；进料装置用于向微滤膜过滤器输送原液，微滤膜过滤器用于滤除原液中的大颗粒杂质，以得到输出的微滤透过液；深层过滤装置用于对微滤透过液进行深层过滤，以得到纯度高于预设值的活性原料；除菌过滤装置用于以膜过滤的方式对活性原料进行除菌处理。本实用新型基于进料装置、微滤膜过滤器、深层过滤装置和除菌过滤装置的联合使用，在对原料进行一次性处理后，即可添加至物料主管线中，确保了系统运行的可靠性，能够稳定地对活性原料进行大批量的连续在线添加。