本发明公开了一种双歧杆菌菌粉及其益生菌的制备工艺，选用包含麦芽糖、磷酸氢钙和泊洛沙姆的保护基质，在喷雾干燥前将菌体与基质混合，提高双歧杆菌的抗热抗逆活性，从而显著提高双歧杆菌喷雾干燥存活率；不仅可以起到提高双歧杆菌存活率的作用，而且还可以使干燥后得到双歧杆菌菌粉流动性好，方便后续的制剂加工。采用本发明制备得到双歧杆菌菌粉作为原料，添加适量乳粉、菊粉、甘露醇和二氧化硅作为辅料，运用现代工业技术制成单剂量包装的粉剂，具有服用方便、起效迅速、口感醇正、易于贮存、计量准确等特点，且制备工艺简单，生产可操作性强，成本低，适于工业化大生产。