本实用新型公开了一种西林瓶超声波清洗系统，包括供水系统和清洗系统，供水系统用于为清洗系统提供清洗用水；供水系统包括：水源系统、灭菌系统、过热器以及排水系统；水源系统中的水经灭菌系统灭菌后供给至过热器中；过热器中的水经温度传感器检测合格后泵入清洗系统，否则经排水系统排出；清洗系统包括：超声波清洗系统、循环冲洗系统、终洗系统以及循环系统；水温检测合格后泵入所述清洗系统中且其中至少一路水流泵入超声波清洗系统中，其余若干路水流泵入终洗系统中；循环系统与超声波清洗系统和循环冲洗系统连通，用于将两者中的水循环流动；待清洗的西林瓶依次在所述超声波清洗系统、循环冲洗系统以及终洗系统中完成清洗。