本发明公开了一种磷酸化改性的鳕鱼胶原蛋白肽的制备方法，包括以下步骤：（1）将鳕鱼皮经过预处理清洗后，经过酶解、离心所得上清液经过脱盐、冻干后制得鳕鱼胶原蛋白肽粉；（2）将鳕鱼胶原蛋白肽粉溶于70‑80℃的水中，再加入磷酸缓释物反应2‑5h后，经过滤、透析，制成磷酸化改性的鳕鱼胶原蛋白肽。本发明所述的磷酸化改性的鳕鱼胶原蛋白肽的制备方法，克服了磷酸化化学试剂在改性鳕鱼胶原蛋白肽的过程中反应过于剧烈，使得蛋白质聚合变性的问题；同时由于磷酸化试剂缓慢释放，并定时终止反应，避免了鳕鱼胶原蛋白肽中的磷酸化试剂残留问题。