本发明提供了一种多肽食品防腐剂，主要由夏威夷果多肽、锡兰莓提取物、蔗糖脂肪酸酯制成，其中，夏威夷果多肽由夏威夷果仁通过碱解酸解制得夏威夷果仁蛋白、再将夏威夷果仁蛋白通过复合酶水解制得，锡兰莓提取物由锡兰莓果肉以乙醇水溶液为提取溶剂通过超声提取而得。本发明还提供了该多肽食品防腐剂的制备方法。本发明提供的多肽食品防腐剂的主要成分为多肽，具有较好的抗菌、抗氧化性能和稳定性。