本发明提供了一种低致敏性酪蛋白肽的生产方法，包括以下步骤：（1）将酪蛋白加入纯水中，加热后保温搅拌，冷却至室温后转入超高压设备中，升压后保压，解压后得到酪蛋白溶液；（2）将瓜尔胶加入纯水中搅拌至混合均匀，加入甲基丙烯酸酐后用氢氧化钠溶液将体系的pH值调节至8‑10，继续搅拌反应后加入复合蛋白酶，加热后保温搅拌得到复合蛋白酶溶液；（3）将酪蛋白溶液与复合蛋白酶溶液混合均匀后得到混合液，置于均质机中均质，取出后调节pH值至7，加热后酶解得到酶解液；（4）将酶解液加热灭酶，冷却至室温后离心得到上清液，将上清液冷冻干燥后得到低致敏性酪蛋白肽。本发明生产出的低致敏性酪蛋白肽的致敏性较低，苦味较小且稳定性较好。