本发明公开了DC/DC电力电子变换器技术领域中的一种双输入氢燃料电池DC/DC变换器及其控制方法，该DC/DC变换器包括两组并联的氢燃料电池，每组氢燃料电池的控制支路中，开关管的一端与氢燃料电池的正极连接，其另一端分别与控制二极管的阴极、电感连接，控制二极管的阳极与氢燃料电池的负极连接，电感的另一端与输出二极管连接；该控制方法采用多闭环串、并联连接关系和控制，实现对DC/DC变换器的输入功率、输出电压、输出电流有效控制。本发明满足了大功率电动汽车动力电池供电需求，提高氢燃料电池电能利用率，克服氢燃料电池电堆并联均压难点，该DC/DC变换器具备体积小、功率密度高、电能转换率高等优势。