本发明公开了一种从一种从自溶表达体系中纯化重组蛋白方法，本方法首次使用了一种工艺组合，通过对料液均质处理、固液分离以及过滤清液的进一步处理和后续的层析浓缩过程，最终获得高度浓缩的重组蛋白。该方法具有控制简单，成本低的特点，针对大肠杆菌自溶表达时碎片较多，料液粘度较高的情况尤其适用，解决了此类发酵液中产物难以分离纯化的困难。