本发明提供一种云桌面高清视频传输方法及系统，将整个桌面区域识别为视频数据，将所述视频数据从云桌面发送给客户端，视频数据经过过滤处理。每秒钟发往客户端的视频帧数可控，我们可以控制在指定范围内。在客户端方面，采用硬件对解码和转码处理加速对视频流的处理速度，来保证客户端的视频流畅；大幅降低了云桌面对带宽的要求，能够使用云桌面播放高清视频；播放视频流量相比以前显著降低，降低服务端对显示处理的复杂度；在图片变化较多的情况下，依然可以流畅操作播放视频稳定，不卡顿，满足3D显示数据传输要求。