本发明涉及一种远程桌面中的差异检测与分区域动态编码方法、电子设备、计算机可读存储介质。其中方法包括：图像差异检测步骤.其用于将被控机每一帧截取到的屏幕图像，拆分成多个小块并编号，并在当前帧中，寻找对应上一帧同一编号小块存在像素变化的各个小块，取其编号形成列表“A”；传输方式检测步骤.其用于对列表“A”中的小块区分不同区域；传输步骤.其用于对不同区域的小块，使用不同的编码器进行传输。本发明能快速检测每帧画面差异，并区分不同区域的编码类型输入给不同编码器，从而带来传输体积、高画面质量和编码速度等方面的优势。