本发明公开了一种具有高抗氧化活性的核桃乳酸菌发酵饮料及其制备方法。所述发酵饮料是以脱脂核桃粕为原料经乳酸菌发酵而成，具体工艺流程是将脱脂核桃粕打浆成核桃乳，经均质、杀菌、冷却后接入乳酸菌进行发酵，其中发酵采用的菌种为保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌的混合菌种，经过多次驯化过程适合纯核桃乳发酵体系。本发明富含植物蛋白和乳酸菌，具有较高抗氧化活性，是一种兼具核桃和乳酸菌发酵食品双重优点的发酵型天然植物蛋白饮料，可应用于功能食品或营养保健制品领域。