本发明公开了一种衬衫用原位聚合抗菌色织纱及其制备方法，属于纺纱工艺领域。本发明所述的制备衬衫用原位聚合抗菌色织纱的方法，包括如下步骤：配棉、梳棉、纺纱、原位交联聚合、染色，得到所述的抗菌色织纱；其中，在梳棉时，通过静电纺丝方法将抗菌微纳米纤维原位植入棉网中，进行混合；原位聚合是将纱线在含有引发剂、交联剂的反应液进行原位聚合；所述的抗菌微纳米纤维中抗菌剂的用量为抗菌色织纱质量的本发明采用的纳米纤维具有非常高的比表面积，其中的抗菌成分作用速度快，并存在缓释效果，因此能极大降低抗菌剂的添加比例；而且本发明的方法克服现有工艺抗菌物质结合不牢、抗菌剂用量高的技术缺陷。