本发明提供一种智能床系统及其控制方法，智能床系统包括：床本体，床本体限定有一开口向上的容纳空间；垫层，垫层设于开口处；多个传感器，多个传感器均匀分布于垫层以用于监测位于垫层上的使用者的监测数据并根据监测数据确定调温区域；调温层，调温层设于容纳空间内且位于垫层下方，调温层与传感器连接以用于根据监测数据调整调温区域的温度；调温装置，调温装置与调温层连接以用于调整调温层的温度。根据本发明实施例的智能床系统，利用床本体、垫层、传感器、调温层和调温装置相结合的结构，通过根据使用者在垫层上的位置确定调温区域，并对调温区域进行调温，不仅可以快速调温，提升人体舒适度，而且还能节约能源。