本实用新型提供一种蛋白沉淀上清液分离装置。具体地，本实用新型提供一种蛋白沉淀上清液分离装置，所述的装置包括沉淀罐、气体源，所述的气体源通过输气管道与所述的沉淀罐相连；所述的沉淀罐的罐壁上设有进料管、出料管、上清液分离器、和视窗；所述的上清液分离器包括套管和取样管，所述的套管穿过所述沉淀罐的上罐壁，所述的取样管穿过所述套管，所述取样管与所述套管之间密封连接且能够自由滑动，所述沉淀罐内的取样管的下端弯曲成与水平面平行，所述沉淀罐内的取样管的管口设有30‑60°上斜切面，沉淀罐外的取样管的管口设有隔膜阀。本实用新型的蛋白沉淀上清液分离装置能够实现蛋白沉淀上清液快速分离，操作简单且保证产品质量。