本申请的实施例公开了一种燃料电池停机控制方法、装置、设备及计算机可读介质，其中，该方法包括：以燃料电池的停机吹扫电流为第一预设电流，对燃料电池中含有的残余水分进行吹扫；在吹扫结束后，对燃料电池的阴极空间进行密闭，并控制燃料电池的放电电流减小为第二预设电流；若燃料电池的电压处于第一预设电压区间，则通过拉载电流控制模块控制燃料电池以主动放电电流进行放电；在燃料电池以主动放电电流进行放电后，若燃料电池的电压减小到第二预设电压区间，则通过放电电阻控制燃料电池进行放电，直至燃料电池停机。通过该方法，可以减少燃料电池停机时间及能耗，并提高燃料电池停机控制的可靠性。