本实用新型涉及一种电子水泵的电机电磁屏蔽结构，它包括电机外壳、电机定子、前端盖组件、后端盖组件、电机转子、控制板、前端盖轴承、后端盖轴承与散热板；还包括前屏蔽板与后屏蔽板，前屏蔽板嵌在对应电机定子与前端盖组件之间的电机外壳的内壁，后屏蔽板嵌在对应电机定子与后端盖组件之间的电机外壳的内壁。本实用新型在满足燃料电池系统要求的介质绝缘基础上，可有效地解决电机电磁干扰问题。本实用新型采用金属材质的前屏蔽板与后屏蔽板将电机定子完全封闭起来，使电机定子无法对屏蔽以外的电器件和泵体内部的电路板产生电磁干扰，具有结构简单、操作便捷以及制作成本低的优点，具有良好的屏蔽效果。