本发明公开了一种氢燃料电池的热管理系统、方法和控制管路，所述系统包括：氢燃料电池控制单元、氢燃料电池、温度传感器、水泵、两个三通电磁阀、散热器、加热装置；所述氢燃料电池控制单元通过控制三通电磁阀的通断及水泵的开启来控制管路中水路的通断与走向，并根据温度选择散热器及加热装置启停对系统实现加热、散热与保温；本发明根据水温进行调控，保证氢燃料电池始终在适宜的环境工作，提高了氢燃料电池的工作效率及使用寿命。