本实用新型提供了一种变压器散热风机分路控制系统，所述系统包括系统供电输入端和系统零线接线端，还包括：继电器电路，所述继电器电路分别和报警设备、散热风机电连接，所述继电器电路用于在熔断器熔断时，使报警设备自动得电报警；熔断器，所述熔断器分别与继电器电路、系统供电输入端电连接。本实用新型解决了变压器因某一台散热风机故障，就会导致存在变压器温度上升带来的安全隐患的问题，同时减少了因某一台散热风机故障导致的变压器停机次数，在散热风机发生故障时能根据报警模块的报警信号第一时间判断故障风机的位置，进一步降低工作人员查看故障时的危险。