本发明公开了一种防治奶牛乳房炎的复合微生态制剂及其应用，以贝莱斯芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌为活性成分复配而成。本发明中的贝莱斯芽孢杆菌和凝结芽孢杆菌菌株对金黄色葡萄球菌、无乳链球菌和大肠杆菌等病原菌有较强抑制作用，复合使用一方面可抑制养殖环境中病原微生物，改善饲养环境，另一方面可抑制病原微生物对奶牛的感染，有效防治奶牛乳房炎。