本发明公开了一种胱氨酸锰的制备方法，包括以下步骤：开启搅拌，将碳酸盐加入到有机溶剂‑水溶液中，搅拌溶解后加入胱氨酸，搅拌至不再有气泡冒出后升温，加入锰源进行反应，反应完成后将反应体系冷却、结晶、过滤、洗涤、干燥，即得到胱氨酸锰。本发明还提供一种上述胱氨酸锰作为动物饲料添加剂在动物中的应用。本发明中，反应分为两步，先将碳酸盐加入到胱氨酸溶液中反应生成胱氨酸盐，再利用胱氨酸盐与无机锰盐反应得到产品，采用上述两步反应可以避免在强碱和高温下反应，胱氨酸自身不易发生副反应，产品纯度高。