本发明公开了一种酵母细胞壁‑抗菌肽A3复合制剂及其制备方法与应用，属于酵母高值化利用技术领域。本发明的酵母细胞壁‑抗菌肽A3复合制剂由酵母细胞壁和抗菌肽A3按质量比（8‑10）：1复配而成；所述酵母细胞壁由如下方法制备而成：将酿酒酵母发酵液固液分离，收集菌体沉淀；将菌体沉淀稀释得到菌液，调节菌液的pH至6.0‑7.0，加入木瓜蛋白酶，控制温度50‑60℃，处理12‑36h；向处理后的体系中加入轻质碳酸钙，混匀，干燥，制备得到酵母细胞壁。本发明的酵母细胞壁‑抗菌肽A3复合制剂能够提高抗菌肽A3在胃蛋白酶和胰蛋白酶作用后的抗菌活性；并且，在提高动物机体生长性能、抗氧化能力及免疫指标等方面具有协同增效作用。