本发明公开了一种含腐植酸螯合微量元素的发酵饲料，是在含有腐植酸螯合微量元素的发酵培养基中接种菌种，发酵，得到含腐植酸螯合微量元素的发酵饲料；所述发酵培养基是由发酵料和水组成；发酵料的原料组成为：豆粕10‑20份、麸皮20‑45份、腐植酸5‑10份、石粉40‑50份、丝穗金粟兰5‑10份、银线草5‑10份、罗布麻叶4‑8份、金龙胆草4‑8份、布渣叶4‑8份、腐植酸螯合微量元素0.7‑1.4份。本发明还公开了该发酵饲料的制备方法。本发明的发酵饲料通过腐植酸与微量元素的螯合，有助于缓解无机微量元素的添加引发的资源浪费和环境污染问题，以及解决氨基酸微量元素螯合物生产费用高、不利于广泛使用的问题。