本发明公开了金色链霉菌突变菌株及其选育方法以及优化的培养基。本发明的突变株能高效合成和积累金霉素、杂质四环素和去甲基金霉素含量显著降低，遗传稳定性良好，连续传代五代其形态、颜色、产金霉素水平以及主要杂质的含量基本稳定，能够应用于工业化发酵生产及作为进一步研究开发的生产菌株。本发明优化的培养基，有利于促进金霉素的合成与积累，进一步减少杂质四环素和去甲基金霉素的比例。本发明基于多重复合诱变和前体/产物耐受构建了高产菌株选育模型，不仅突变库的多样性更高，而且简便快捷，提高了筛选效率并减少了筛选工作量，对金霉素及其他链霉菌来源抗生素的生产成本降低和产能提高都具有一定的应用价值和指导意义。