本发明公开了一种日志采集方法和系统。本发明的日志采集系统包括部署在容器运行的主机上的agent和日志采集服务器。本发明的日志采集方法包括：利用部署在容器运行的主机上的agent采集主机中的容器信息，并将采集到的容器信息发送到预先构建的日志采集服务器上，利用日志采集服务器将容器进行归类并为每类容器设置日志采集路径；在接收到日志采集服务器发送的日志采集路径配置成功的通知消息时，agent根据通知消息从日志采集服务器拉取日志采集配置信息；agent根据日志采集配置信息进行日志采集，获取日志并发送给日志采集服务器。本发明日志采集方案可以避免容器漂移导致的应用日志采集困难的问题，具有较高的通用性。