本申请公开了一种身份认证方法、装置、系统、电子设备及存储介质，身份认证系统中的量子密钥灌装模块将从第一量子密钥分发设备获取量子密钥信息灌装至目标账户的硬件密码设备中，硬件密码设备中还包括发证中心向目标账户下发的数字证书和签名密钥；所述方法，包括：目标账户的客户端从硬件密码设备中选定第一量子密钥；将利用签名密钥对第一量子密钥进行签名生成签名值、第一量子密钥标识和目标账户标识发送至身份认证中心，以使身份认证中心根据目标账户标识从发证中心获取目标账户的数字证书，根据第一量子密钥标识从第二量子密钥分发设备获取第一量子密钥标识对应的第二量子密钥，根据第二量子密钥和数字证书中的公钥对签名值进行验证。