本发明涉及荧光检测领域，公开一种荧光检测光学系统。所述荧光检测光学系统包括载物台、光路模块和调节机构，载物台用于放置待检测样本，载物台设置有检测通道；光路模块用于激发并检测待检测样本的荧光信号，光路模块内设置有检测光路，检测光路与检测通道连通；调节机构包括第一调节组件和第二调节组件，第一调节组件用于调节待检测样本与检测通道对准，第二调节组件用于调节待检测样本与检测光路的聚焦点重合。本发明提供的荧光检测光学系统，样本位置校准简便精确，光路结构简单，光路布局合理紧凑，易于实现小型化及模块化。