本发明公开了一种U肋双侧自动打磨除锈系统，包括：底部加工座，具有放置区和除锈加工区，放置区分为上料区和下料区，底部加工座的放置区安装有活动机架和固定机架，活动机架和固定机架均具有底部机架座、上料立柱、下料立柱和顶部横梁架，上料立柱和下料立柱顶部固定安装有顶部横梁架；底部机架座上还固定安装有对应上料区的上料放置座和对应下料区的下料放置座；还包括上料机构、下料机构、喷砂除锈机构、重锤摆动式托辊、以及转移夹送机构。本发明自动化程度高，可自动完成单根U型肋的上料、喷砂除锈作业以及下料的全部过程，基本无需人工干预，很好地降低了人工成本，提高了生产效率，整个系统设备的空间占用小。