本申请提供一种二氧化碳测定仪搅拌装置及二氧化碳测定仪，涉及二氧化碳测定技术领域。其中，二氧化碳测定仪搅拌装置包括：安装支架，安装支架连接于二氧化碳测定仪的反应瓶的底部；磁盘，磁盘设于安装支架的顶部；搅拌子，搅拌子用于放置于反应瓶内，且与磁盘磁性吸附；驱动装置，驱动装置连接于安装支架的底部，且与磁盘驱动连接，驱动装置驱动磁盘转动，以使搅拌子在反应瓶内旋转。本申请通过磁盘与搅拌子配合进行搅拌，避免在反应瓶底部开口，从而保证了反应瓶的密封性，保证了测试结果的准确性。