本发明涉及微生物采样技术领域，尤其涉及一种海水微生物采样设备，该技术方案为：一种海水微生物采样设备，包括有支撑板、连接架和圆板等；支撑板上设置有连接架；连接架上固接有圆板。牵引绳由紧绷状态转变为松弛状态，如此，牵引绳便失去了对盖板的拉力，盖板在与其连接的弹簧的弹性复位作用力下便会快速在采样瓶内向下移动，使得通水槽被封堵住，不再与外界连通，海水便再无法进入，由此，能够避免不同深度的海水混合在一起。