本发明涉及一种防腐柔性环氧复合卷材及其制备方法和应用，该柔性环氧复合卷材包括依次层叠设置的第一树脂层、第一加强层、第二树脂层、第二加强层和第三树脂层，第一树脂层、第二树脂层、第三树脂层分别以光固化环氧丙烯酸树脂和光固化聚氨酯丙烯酸树脂复配作为主体原料，光固化环氧丙烯酸树脂选自脂肪族柔性长链改性的环氧丙烯酸树脂；光固化聚氨酯丙烯酸树脂选自多官能度的脂肪族聚氨酯丙烯酸树脂。本发明的三层树脂层不仅保留了环氧树脂的固有特性，而且增加了丙烯酸树脂和聚氨酯树脂优点，同时从分子层次对膜层进行增韧，形成弹性体内增强的交联网络复合膜层结构，使复合树脂体系同时具有耐候性、柔韧性以及良好的机械强度。