本发明公开了一种磷石膏脱硫制备贝利特硫铝酸盐水泥熟料的工艺，获取磷石膏，经干燥、破碎、粉磨，与硅铝铁质原料按照低KH值、低IM值的水泥熟料配料后混合粉磨；所得低KH值、低IM值混合料经预热器进入脱硫炉，加入碳质原料进行CaSO4的脱硫；所得脱硫物料冷却后加入钙质原料、铝质原料、石膏进行混合粉磨，使得IM值和PM值达到贝利特硫铝酸盐水泥熟料的标准要求；进入分解炉进行碳酸盐的分解；分解的生料进入回转窑煅烧，制得贝利特硫铝酸盐水泥熟料；本发明采用了低KH值配料脱硫的同时对IM值进行限制的方法，在实现磷石膏高效脱硫的同时限制了Al2O3含量高对磷石膏脱硫产生明显抑制作用的影响，开发了一种磷石膏高效脱硫且用于制备贝利特硫铝酸盐水泥熟料的方法。