本发明公开了一种燃料电池及其控制方法，燃料电池包括电池反应堆，对电池反应堆进行降温的冷却回路、以及控制电池反应堆和冷却回路工作的燃料电池系统控制器，所述冷却回路包括穿过电池反应堆的冷却管道、水泵、散热器、加热器以及恒温三通阀，其特征在于：冷却管道第一出水口与冷却管道第一进水口之间连接有冷却剂补充回路，冷却管道第一进水口处设有第一温度传感器、冷却管道第一出水口处设有第二温度传感器，燃料电池系统控制器根据第一温度传感器和第二温度传感器检测到的冷却剂温度数据控制恒温三通阀、水泵及加热器工作。燃料电池在低温冷启动时通过加热器对冷却剂进行加热，使冷却剂迅速升温，缩短了冷启动等待时间，提高了效率。