本发明公开了一种燃料电池供氢回氢系统及燃料电池，包括电堆氢气出口管、电堆氢气入口管、水汽分离器、吹扫阀、供氢模块和回氢泵，含有氢气的混合气体通过电堆氢气出口管汇入到水汽分离器进行一次水汽分离，水汽分离器分离出来的氢气通过歧管连接到回氢泵的进氢口，主管设置有一段爬坡段，主管出口连接到回氢泵的进氢口，支管从爬坡段的底部分支出来，支管的出口端连接吹扫阀，水汽分离器分离出来的氢气经过爬坡段时形成二次水汽分离，分离出来的水滴沿着爬坡段汇流到支管从吹扫阀排出。它结构紧凑，体积小，有效实现水汽分离，降低系统电堆水淹的风险，废水废气分别排出，提升系统用氢经济性和可靠性。