本发明公开了一种呼吸口结构、菌丝培养装置及菌丝体的培养方法，包括第一呼吸结构体、与第一呼吸结构体装配的第二呼吸结构体；第一呼吸结构体形成有第一呼吸口；第二呼吸结构体被配置为尺寸与第一呼吸结构体朝向呼吸口结构内部一侧匹配的结构，且第二呼吸结构体形成有第二呼吸口；嵌入第一呼吸结构体和第二呼吸结构体之间的过滤组件；本发明的呼吸口结构以第一呼吸结构体和第二呼吸结构体组合而成，并在两者上设计第一呼吸口和第二呼吸口，通过第一呼吸口和第二呼吸口之间形成的多条气道实现气流导通，同时，在气道内嵌入过滤组件，实现径流气体的过滤和净化，该呼吸口结构整体结构新颖、装配和拆卸方便、既保证了气体流通又实现了气体过滤。