本发明公开了一种融合蛋白、融合蛋白疫苗及其制备方法、应用，将TbpB蛋白的氨基酸残基序列中的至少一部分抗原表位区序列替换为TbpA蛋白的氨基酸残基序列的至少一部分抗原表位区序列，所得的序列为所述融合蛋白的氨基酸残基序列。本发明为了使TbpA的抗原性得到稳定形式的表达，利用TbpA和TbpB所共有的β‑桶结构特征，设计了以TbpB为支架，将TbpA的若干个表面区域的抗原决定簇替换TbpB的若干个较大的可变环区抗原决定簇，得到了TbpA+B融合蛋白，这种融合蛋白同时具有两种蛋白的抗原性，并且可以通过原核细胞表达系统得到大量的可溶形式的表达，适合于疫苗的商业化生产。