本发明提供了一种二氢杨梅素和牛蒡苷的联合提取方法及其在清咽产品中的应用，涉及化学纯化技术领域，该联合提取方法包括如下步骤：（1）将藤茶、牛蒡子干燥后粉碎，得到藤茶粉末和牛蒡子粉末，将牛蒡子粉末脱脂后与藤茶粉末混合，加入至溶剂A中浸泡，第一次微波提取，过滤，得到滤液A和滤渣，将滤渣加入至溶剂B中浸泡，第二次微波提取，过滤，得到滤液B；（2）将滤液A和滤液B混合后，过层析柱，分别得到二氢杨梅素和牛蒡苷。该提取方法简单高效，能够同时提取出纯度以及含量较高的二氢杨梅素和牛蒡苷用以清咽产品的制备。