本发明提供一种冰机除液系统及其除液方法，通过设置在分离器上的第一压力变送器、温度变送器和第一液位变送器实时压力、温度和液位高度，并根据实时压力和温度计算分离器中气体的冷凝裕度，根据液位高度计算实时液位上升速率，根据冷凝裕度和液位上升速率，对热气旁通阀的阀门开度进行调整，让热气进入，将液体汽化，完成除液；同时还可以通过将分离器中的液体通过重力流向中间槽，再通过压力将中间槽的液体排向省功器中，再由省功器排出至用户使用，从而完成除液。该方案解决了大部分机组误报停车的问题，把误报造成机组停车的机率降低90％，提高了机组的稳定性；并且设计了新的除液方式，实现了整个流程的自动化控制，提高了除液效率。