本发明提供一种混合型化肥生产废水生化处理方法，具体步骤是将混合型废水经过格栅除去大块漂浮物后进入集水井，缓存、配水、吹脱、均化、加入助凝剂和絮凝剂再进入初曝池；初曝池中投加高效微生物制剂HSBEMBMR，加磷酸二氢钠以补充营养物质P，去除混合型废水中抑制脱氮菌属的有毒有害物质；初曝池出水自流至初沉池，初沉池出水自流至兼气池、好氧池、多功能池进行脱氮、脱碳处理阶段，其中，初曝池中投加高效微生物制剂HSBEMBMR；多功能池出水至二沉池，进行泥水分离，出水达标后跨越絮反终沉池至清水池排放经处理后打入终沉池，终沉池出水自流至清水池排放或回用。该类废水处理后回用于厂区的循环水系统，回用率达到85%以上，环境效益和经济效益显著。