本发明公开了一种金属氨基酸螯合物的制备方法，反应物中的金属化合物与配体氨基酸按克分子比例配制成水悬浮液，经过预处理后，注入高压液体纳米磨中，利用气穴坍塌作用原理，产生很强的冲击压、瞬时高温和超高频率的超声波等共同作用于反应物悬浮液，致使配体氨基酸共价键均裂形成自由基，瞬时与含有不成对价电子的金属离子结合成为金属氨基酸螯合物。本发明金属氨基酸螯合物制备方法具有生产周期短，产率高、不产生硫酸盐和氯化物有害杂质等优点，反应产物纯度高，除氨基酸螯合物外，只有水的生成，产物经脱水处理可直接作为氨基酸螯合物制品，用于医药和食品。