本实用新型公开了隐藏式排水结构及应用其的门窗，隐藏式排水结构，包括型材与防护盖，型材设有排水槽，排水槽的顶壁设有排水孔；防护盖组装于排水槽，防护盖设有面板与流体通道，流体通道与排水孔连通，流体通道的末端设有活动挡板，防护盖的面板与活动挡板配合，能够挡住正向与侧向的风流，并防止水逆流。