本实用新型提供了一种无菌的分装存储装置，包括塑料容器瓶、进样管、第一鲁尔接头组件和微孔过滤器；进样管一端连接第一鲁尔接头组件，另一端与塑料容器瓶的内腔密封连通；微孔过滤器与塑料容器瓶的内腔密封连通。本实用新型的无菌的分装存储装置结构简单、操作方便，无需在超净工作台中进行分装工作，也无需反复使用移液器，无需将制备好的生产用菌种和毒种在超净工作台中多次加入种子瓶，节省了人力，提高了效率；全过程均在无菌管路中实现分装，无需开盖和封盖，降低了菌种和毒种的受污染风险；塑料材质的容器瓶可以将菌种和毒种保存在负20摄氏度的环境中，不存在低温破碎风险。在此基础上，本实用新型还提供了一种快速无菌分装存储系统。