本发明提供了一种嵌入式设备恢复出厂配置的方法、系统和嵌入式设备，所述方法包括预先对目标配置文件配置第一标识；响应于设备升级或重启操作，在系统环境变量中配置第二标识；响应于所述设备开机操作，读取数据库文件，并判断所述系统环境变量中是否存在所述第二标识；当所述系统环境变量中存在所述第二标识时，判断所述目标配置文件中是否存在所述第一标识；当所述目标配置文件中存在所述第一标识时，调用所述目标配置文件并恢复出厂配置。本发明实施例能够简化嵌入式设备恢复出厂配置的步骤，减少设备升级或重启的维护时间，提高产品本身的可靠性和提升用户体验。