本发明公开了一种后路粉制小麦淀粉及谷朊粉的方法，依次包括如下步骤：对不同批次的后路粉进行配粉，使面筋指数达50%以上，降落数达500s以上；面粉与工艺过程水按照10:8的比例进行混合和面，并且按0.05kg/t绝干面粉的比例加入降黏酶并混合成均匀的面浆；面浆与工艺过程水混合后共同进入三相卧螺离心机中进行分离，进料浓度为35%‑40%，分离后重相为A淀粉乳、中相为B淀粉乳+面筋、轻相为戊聚糖；将A淀粉乳送入两相卧螺离心机中分离，重相为A淀粉，将其脱水至A淀粉干物含量为60%‑62%出料；将A淀粉粉碎、烘干且筛分合格后出料。本发明可制得优于国标的A淀粉和谷朊粉，且能耗低，提高工厂的经济效益。