本发明公开一种富硒糖醇螯合型中微量元素生物菌剂及其制备方法，属于农用微生物技术领域。本发明微生物菌剂包括以下原料制备而成，硒盐0.15‑0.3份、活化糖醇10‑30份、中量元素30‑50份、黄腐酸10‑15份、微量元素4‑8份、微生物发酵液3‑5份、水50‑100份。其中活化糖醇、黄腐酸、微生物菌剂，三者相互配合螯合作用明显，共同促进作物对于中微量元素和硒元素的吸收，大幅提升作物产量、品质，同时本发明液体生物菌剂，还可促进土壤团粒结构形成，活化板结土壤，增强土壤保水保肥能力，有效提高肥料养分利用率，长期使用对环境无危害，具有广阔的经济效益和社会效益。