本发明公开了一种绿色高效土壤磷肥增效剂及其制备方法，属于微生物发酵技术领域。本发明绿色高效土壤磷肥增效剂由调节剂，动物粪便，螯合剂，微生物菌剂，草酸，腐殖酸，保水剂，尿素，磷酸二氢钾组成。本发明以松针叶为原材料制备的磷肥增效剂，原料废弃资源利用；加入的绿色木霉菌、黑曲霉菌、巨大芽孢杆菌进行协同作用，明显促进了难溶性磷的溶解；还在制备过程中加入保水剂起到保水作用，加入的磷酸二氢钾、尿素引入了钾、氮元素；腐殖酸、硫磺粉、动物粪便对土壤进行改良，螯合剂对金属离子进行结合，草酸对难溶性碳酸钙进行溶解，大幅度提高了土壤中可溶性磷的含量，并且所用原料均为环境友好型，不会污染，使用方便，适合广泛应用。