本发明涉及一种自定义库处理方法、装置及系统，该方法分别应用于开发平台和组态平台。在开发平台中，当用户完成各个算法单元的编译时，检验各个算法单元的合法性，若合法则导出自定义库，对库信息及各个单元信息签名获得校验值后，将库信息、各个单元信息及校验值保存到信息文件并加密，将文件发送至存储空间。在组态平台中，当用户要调用自定义库，从存储空间获取文件并解密后，校验库信息及单元信息，若校验通过，且能在组态平台导入该自定义库，且用户拥有调用自定义库的权限，则导入自定义库。应用该方法，能够对自定义库对应的文件进行加密和签名，防止文件在传输过程被篡改，并在调用该文件时还需要校验该文件，避免导入被篡改自定义库。