本发明涉及一种基于DCS系统和掌上终端的自动化生产方法及系统，DCS系统与掌上终端通信连接；DCS系统执行预先编辑的生产过程控制逻辑；该生产过程控制逻辑中包括第一程序实例所对应的提醒用户进行输入信息的信息，第一程序实例为该生产过程控制逻辑中需要用户输入输入信息的程序实例；方法包括：当DCS系统执行到第一程序实例时，DCS系统将预先组态后的第一程序实例所对应的提醒用户进行输入信息的信息推送到掌上终端；掌上终端接收用户输入的输入信息，并将该输入信息传输至所述DCS系统；DCS系统根据输入信息继续按照生产过程控制逻辑进行处理，获取处理结果。