本发明提供了一种自动定位扫码贴标的方法及其系统，包括步骤：位置获取，将粘贴有厂商来料标签的料盘放置在扫码平台上，使所述料盘的圆心穿过所述扫码平台的中心固定柱，通过CCD识别装置拍摄所述料盘及料盘上的厂商来料标签；位置校准，将所述厂商来料标签调整至扫码区域；形成解码标签，扫码器自动扫描并依次读取调整至扫码区域的所述厂商来料标签上的所有条码信息，得到每个条码信息对应的解码信息，根据所述解码信息，形成解码标签；贴标，将所述解码标签贴至与所述厂商来料标签相对的贴标位置。本发明无需人工每次测量时都做精准摆放，解决了人员必须指定精确位置摆放产品带来的作业难度，提升解码率以及贴标品质。