本发明提供一种利用普洱茶熟茶或黑茶中有益菌群制备活菌食品的方法。普洱茶和黑茶是后发酵茶，通过后发酵及陈化过程，茶中的有益菌群将茶中的一系列物质转化，逐渐形成普洱茶熟茶特有的茶色素、茶多酚、茶氨酸、维生素等营养成分，从而赋予黑茶或普洱茶熟茶独特的功能，比如改善肠道功能、平衡微生态环境、健胃、减肥等。黑茶和普洱茶熟茶的功能一部分源于其内部的功效化学成分，另一部分源于其后发酵中形成的微生物本身。因此将黑茶或普洱茶中有益菌群分离出来，并用于制备酸奶、饮料等含有活菌的食品，可以进一步利用黑茶和普洱茶的独特保健功效为健康服务。